首先是对MES系统认识不足，对MES系统认识不足主要反映在搞不清楚MES能为企业带来什么好处，对企业管理有什么好的改善。
MES是一种管理的手段和方法，但并不能代替管理本身。对于生产流程、物料追踪的粒度（如单件管理还是批次管理等）、质量管理流程的管控等生产管理制度，MES很多情况下是对企业的一种适应。
图一：智能MES车间管理系统
但MES毕竟不同于以往的传统管理方式，为了让MES顺利实施，也为了更好地发挥MES的强大作用，需要企业仔细了解MES的具体功能。
其次就是对需求难以准确把握度不够，这一点其实是和第一点相关联。在搞不清楚MES不能做什么的情况下，企业往往倾向于认为MES能解决所有的问题，因此需求不能很好的把控，在“无限”增长的需求下，MES是一定无法顺利完成的。MES多工厂模型探讨（下）
项目签订合同前，企业需要提前内部定义一轮需求，并且根据预算和紧急程度，进行第一轮的筛选。实施开始阶段，要求实施团队保证充分的调研，并且形成详细的调研文档，企业相关部门人员仔细论证之后确认签字。
最后就是企业MES人才匮乏，尽管MES已经有几十年的历史，但国内的推广却相当慢，特别是在离散制造行业，不夸张地说，接触MES也是最近几年的事情，更别提MES人才队伍。
图二：MES软件应用功能展示
而MES的特点使得这样的人才不能简单地等同于IT人才。不同于以财务为主线的ERP系统，MES覆盖面及其广泛，包括生产计划、物料追溯与追踪、质量管理、设备管理等生产运营管理的方方面面，因此天然要求MES人才需要有综合素质。
因此企业在实施MES时，公司需要组建合理的团队，需要搭配IT人员的同时，也要配备生产部门、设备部门等其他业务部门的人员。至于由哪个部门牵头则是“因企而异”，重要的是牵头负责人，最好有IT和生产业务的综合背景。
同时，企业在实施MES过程中，建议做好相应的人才队伍培养工作，以便系统在使用过程中出现问题时，可以内部快速解决简易问题，对于系统问题，企业也可以快速定义并锁定问题，提高异常响应效率。
